[ODP1A] a. 系統解析・分類・タイピング

[ODP-003] ヒトのFilobacterium属菌は独立した菌種である

○池 郁生 (理研・BRC・実験動物開発室)

CARバチルス'（通称）は様々な動物で報告され，16S rRNA遺伝子（rDNA）配列からそれぞれ近縁であるとされる。我々は慢性呼吸器疾患のラットから分離した'CARバチルス'をFilobacterium rodentium（基準株はSMR-C^T）と命名した（2016)。2019年，HolmanらによりFilobacterium属菌がウシの鼻咽頭部菌叢に含まれることがわかった。'CARバチルス'が菌叢を構成する報告は初めてだった。我々はHolmanらのメタゲノムデータを再解析し，Filobacterium属菌のrDNA配列が確かに複数のウシから検出されることを確認し，さらにその配列はヒトを含めた動物や，様々な土壌環境に認められることが分かった。
【方法】SRP128145（ペアエンド，250 bp）から，SMR-C^T rDNA配列（LC055729）との相同性が高く，さらにウシ'CARバチルス'rDNA配列（AF316115）と94%以上一致する配列を選び，ウシの共通配列（BoC）とした。BoCをクエリとして相同性解析を進めた。
【結果および考察】調べた鼻咽頭部菌叢データすべてにBoCと99%以上一致する配列が含まれていた。BoCを用いてBLASTn解析を行うと，野生のビッグホーン（99%一致）や，ブタ扁桃（同96%），急性中耳炎や肺疾患のヒト（同93%），土壌（同92%）などの未培養菌がヒットした。BoCとSMR-C^Tの配列同一性は87%だった。系統樹を描くとヒトFilobacterium属菌は独立した菌群を形成した。これらは，ウシ'CARバチルス'がF. rodentiumと科レベルで近縁であり（Filobacterium科は1科1属），ヒトFilobacterium属菌が独立した菌種で，そしてFilobacterium属菌が広く環境に常在することを示唆する。ヒトFilobacterium属菌の病原性解明は今後の課題である。