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アカデミックイベント » シンポジウム

1SAP スーパーコンピューター「富岳」による創薬・医療の⾰新

2022年9月28日(水) 13:50 〜 16:20 A会場 (函館アリーナ武道館A)

オーガナイザー:荒木望嗣(京都大),池口満徳(横浜市立大)

共催:⽂部科学省「富岳」成果創出加速プログラム「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」

Drug discovery and medical technologies are being innovated by development of high performance computing (HPC). Large-scale molecular dynamics simulations performed on supercomputer Fugaku permit atomic-level observation of “slow” biomolecular processes such as protein conformational transition and protein-drug interaction processes, providing deeper insight into molecular mechanisms of disease and drug design to overcome it. In this symposium, we will discuss about the forefront of next-generation molecular simulation techniques for drug discovery and medical treatment.

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13:50 〜 13:53

[1SAP-00] はじめに／Opening Remarks

13:53 〜 14:17

[1SAP-1] 超高周波超音波照射下での分子動力学シミュレーションによるタンパク質-医薬品結合プロセスの加速／Hypersound-perturbed molecular dynamics to accelerate slow protein-ligand binding processes.

〇荒木望嗣¹、奥野恭史¹ (1.京大・院医)

14:17 〜 14:41

[1SAP-2] スーパーコンピューター「富岳」による創薬へ向けた自由エネルギー摂動法の開発／Development of the free-energy perturbation method toward drug discovery on supercomputer Fugaku

〇尾嶋拓¹、杉田有治^1,2,3 (1.理研・BDR、2.理研・R-CCS、3.理研・CPR)

14:41 〜 15:05

[1SAP-3] Binding Kinetics of Kinase Complexes by PaCS-MD/MSM

〇竹村和浩¹、北尾彰朗¹ (1.東工大・生命理工)

15:05 〜 15:29

[1SAP-4] MDシミュレーションで考える抗原-抗体界面：合理的な抗体医薬品設計に向けて／A molecular dynamics study on the antigen-antibody interface: Toward rational antibody drug design

〇山下雄史¹ (1.東京大学)

15:29 〜 15:53

[1SAP-5] 大規模分子動力学シミュレーションを用いた上皮成長因子受容体キナーゼの活性化メカニズムの研究／A study of activation mechanism of epidermal growth factor receptor kinase using large-scale molecular dynamics simulations

〇井上雅郎¹、浴本亨¹、山根努²、池口満徳^1,2 (1.横浜市大・院生命医科学、2.理研・計算科学研究センター)

15:53 〜 16:17

[1SAP-6] Extracting protein dynamics from experimental cryo-EM maps using a machine learning technique combining with MD simulations

〇松本篤幸¹、石田祥一²、寺山慧²、奥野恭史^1,3 (1.京都大・院医、2.横浜市大・院生命医、3.理研・計算科学研究センター)

16:17 〜 16:20

[1SAP-99] おわりに／Closing Remarks