[3E1] [General Session] 13. AI Application

[3E1-01] Predicting the protein stability changes upon single-point mutation using BPE Sequence to Sequence

〇Keisuke Kawano¹, Satoshi Koide¹, Imamura Chie¹ (1. TOYOTA CENTRAL R&D LABS., INC)

Keywords:Bioinfomatics, Sequence to sequence, protein

単変異によるタンパク質の耐熱性変化予測に対してはこれまで，実際の実験データをもとにした教師あり学習が用いられてきた．しかし，ラベルつきデータの数は十分ではない．本研究では大量のラベルなしアミノ酸配列データを用いてSequence to sequenceモデルの教師なし学習を行い，新規の特徴量を作成する．作成した特徴量を用いて耐熱性変化予測を行い，既存の予測手法と精度を比較する．