JSAI2018

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General Session » [General Session] 13. AI Application

[3E1] [General Session] 13. AI Application

Thu. Jun 7, 2018 1:50 PM - 3:10 PM Room E (4F Queen)

座長:桂樹 哲雄(豊橋技術科学大学)

1:50 PM - 2:10 PM

[3E1-01] Predicting the protein stability changes upon single-point mutation using BPE Sequence to Sequence

〇Keisuke Kawano1, Satoshi Koide1, Imamura Chie1 (1. TOYOTA CENTRAL R&D LABS., INC)

Keywords:Bioinfomatics, Sequence to sequence, protein

単変異によるタンパク質の耐熱性変化予測に対してはこれまで,実際の実験データをもとにした教師あり学習が用いられてきた.しかし,ラベルつきデータの数は十分ではない.本研究では大量のラベルなしアミノ酸配列データを用いてSequence to sequenceモデルの教師なし学習を行い,新規の特徴量を作成する.作成した特徴量を用いて耐熱性変化予測を行い,既存の予測手法と精度を比較する.