Best Presentation Award 3

[IIIYS-02] 黒毛和種と交雑種(黒毛和種×ホルスタイン種)のルーメン微生物叢の比較

〇Yoshiaki Sato¹, Kento Tominaga¹, Hiroaki Takebe¹, Kazato Oishi¹, Hajime Kumagai¹, Takashi Yoshida¹, Hiroyuki Hirooka¹ (1.Kyoto Univ.)

【目的】近年、次世代シーケンサーによるルーメン微生物叢の解析が行われている。本研究の目的は黒毛和種と交雑種(F₁;黒毛和種×ホルスタイン種)のルーメン微生物叢を比較し、その違いを明らかにすることである。【方法】同一の飼料を1ヶ月間程度給与した各6頭の黒毛和種(14.7±1.44ヶ月齢)およびF₁（11.1±0.39ヶ月齢）去勢肥育牛よりルーメン液を採取した。ルーメン液よりDNAを抽出し、16S rRNAアンプリコンシーケンス(V3-V4領域)およびショットガンシーケンスを行った。前者ではα多様性（Shannon指数、アンプリコンシーケンスバリリアント（ASV）数）およびβ多様性の解析を行った。後者では微生物群集構造解析および糖質関連酵素に関する機能解析を行った。【結果】Shannon指数は差がみられなかったが、ASV数は黒毛和種で大きい傾向がみられた。また、2品種間のルーメン微生物叢に違いがみられた。黒毛和種にはRuminococcaceae科の7種（セルロース分解菌）が、F₁にはPrevotellaceae科の12種の割合が有意に高かった。セルロースやヘミセルロース代謝に関する酵素群および糖結合モジュールの中に黒毛和種で高頻度に現れるものがみられた。以上より、黒毛和種はF₁と比較し、炭水化物代謝に関する酵素群に違いがあり、セルロース等の繊維分解に寄与する細菌が多いことが示唆された。