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[II-16-30] 牛伝染性リンパ腫ウイルス (BLV) 感染に関するゲノムワイド関連解析
【背景と目的】牛伝染性リンパ腫ウイルスは、家畜伝染病予防法により監視伝染病に指定される地方病型牛伝染性リンパ腫の原因ウイルスであり、近年その感染牛の増加が問題となっている。本研究では、BLV感染・非感染に関連するウシゲノムの一塩基多型(SNP)の同定を目的とした。【方法】 感染農場からランダムに選択したホルスタイン牛400頭について、BovineSNP50 BeadChipを用いてゲノムワイド関連解析(GWAS)を行い、感染・非感染と有意に関連する多型を抽出した。それらの多型について、フィールドでの検証を行うため、陽性率50%以上の農場で飼育されている6歳以上の牛70頭について、ダイレクトシーケンス法により遺伝子型判定を行い、感染牛、非感染牛の2群に区分し、各アレルにおいてFisherの正確検定を行った。【結果と考察】感染・非感染と有意に関連するSNPは8多型見出された。6歳以上の非感染牛について、SEL1L3近傍の多型およびUBE2K近傍の多型が感染・非感染と有意に関連することが分かった(OR=5.14, 95% CI=1.27-25.61, p=0.013)。よって、当該多型を解析することにより感染抵抗性牛を特定できる可能性が示唆された。 今後はSNP近傍遺伝子の発現量を調べ、見出された多型が近傍遺伝子の発現量に影響を及ぼしているかを調べる予定である。