育種・遺伝2

[II-16-36] 日本コウノトリ始祖集団のMHCクラスII領域の多様性の解析

*Takuro Atsumi¹, Yukio Taniguchi¹, Kazuaki Naito², Norihide Yokoi¹ (1. Kyoto Univ., 2. Univ. of Hyogo)

【目的】希少動物のコウノトリの保全には、生息環境の保護や個体数増加の施策に加え、集団内の遺伝的多様性を維持することも重要である。MHCクラスII領域の多様性については、日本コウノトリ集団の始祖個体6羽から、10種類のハプロタイプが同定されている(Tsuji et al. 2017)。本研究では、日本集団のMHCクラスIIの多様性を把握するために、始祖個体やその後代個体25羽を対象として、始祖集団のクラスIIハプロタイプの特定を試みた。【方法】解析個体のゲノムDNAから、クラスII全域を増幅し、産物鎖長からMHC-IIA/IIB遺伝子ペア数を推定した。2ペア/2ペアの個体では、増幅産物をクローニングし、1個体につき少なくとも8クローンに対して、2つのIIB遺伝子座のエキソン2のシークエンス解析を実施した。2ペア/1ペアの個体では、各IIB遺伝子座を独立に増幅後、ダイレクトシークエンスにより、3遺伝子座のエキソン2の配列を決定した。【結果】今回11種類の新規ハプロタイプが検出され、合計21種類となり、比較的高い多様性を持つことが示唆された。いくつかのエキソン2は1塩基のみの非同義置換が見られた。この結果を基に、始祖集団のクラスIIハプロタイプを推定した結果、始祖個体26羽の計52個のハプロタイプのうち、41個ののハプロタイプが特定された。