[ODP4A] a. Genome, Plasmids, Horizontal Gene Transfer, Mobile Genetic Elements, and Evolution

[ODP-050] Comparative genomic analyses of Helicobacter cinaedi and its close relatives Helicobacter spp.

○Junko Tomida¹, Ryo Kutsuna¹, Tohru Miyoshi-Akiyama², Yoshiaki Kawamura¹ (¹Dept. Microbiol., Sch. Pharm., Aichi Gakuin Univ., ²Pathogen Microbe. Lab., Nat. Center Global Health & Med.)

【背景】Helicobacter cinaediは微好気性環境で生育するグラム陰性ラセン菌であり，近年，分離報告が増加している注目すべき菌種である。本菌感染症は菌血症や蜂窩織炎等を呈し，除菌治療後完治したとみなされていた患者が再発する症例が多く報告されている。生体内防御機構および抗菌薬作用から回避した菌体が生体内に留まり続け，何らかの作用により再度増殖し再発を引き起こしていると予想されるが，生態や病原性は不明な点が多い菌種である。
【方法】H. cinaediおよびその近縁菌種のDNAを抽出し，Illumina MiSeqを用いてゲノム配列決定を行った。比較解析はRAST serverを使用し，H. cinaediのゲノム配列における特徴を探索した。
【結果】近縁菌種との比較ゲノムの結果，他のHelicobacter属菌種には存在していないH. cinaediに特有の複数の領域が見出された。そのひとつであるVapCは，tRNA切断に関わるtoxinであり，細菌の増殖制御やストレス応答への関与が示唆されている。また，走化性・運動性に関わる特有の遺伝子群も見出された。これらの菌種特異的な領域が，H. cinaediの高い再発性に関与しているのではないかと推測された。