[SODP-1] Shotgun metagenome analysis using Illumina NextSeq1000/2000 platform
ベンチトップ型次世代シーケンサーで行う16S rRNA解析が微生物解析では一般的になってきましたが，薬剤耐性遺伝子などの解析には16S rRNAに代表されるメタバーコーディング（アンプリコンシーケンス）解析では不十分な面があることも知られてきています．今回の発表では，2020年に販売された中型シーケンサーNextSeq1000/2000を使用したショットガンメタゲノム解析についてのアプリケーション紹介をさせていただきます．