第95回日本細菌学会総会

講演情報

企業オンデマンド口頭発表

[SODP] 企業オンデマンド口頭発表

[SODP-1] NextSeq1000/2000で行うショットガンメタゲノム解析について

小林 孝史 (イルミナ株式会社)

ベンチトップ型次世代シーケンサーで行う16S rRNA解析が微生物解析では一般的になってきましたが,薬剤耐性遺伝子などの解析には16S rRNAに代表されるメタバーコーディング(アンプリコンシーケンス)解析では不十分な面があることも知られてきています.今回の発表では,2020年に販売された中型シーケンサーNextSeq1000/2000を使用したショットガンメタゲノム解析についてのアプリケーション紹介をさせていただきます.