The 21st Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan

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Young Poster Award Flash Talk

[1FT-1] Structural biology (1P-01~1P-25)

Wed. Jun 16, 2021 2:00 PM - 2:30 PM Channel 1

Chairs: Hiroshi Yamaguchi (Kwansei Gakuin Univ.), Terukazu Nogi (Yokohama City Univ.)

[1P-08*] Structure and function analysis of a novel lectin like protein

Hiromu Kageyama1, Kako Onodera1, Takashi Matsui1,3, Tomohisa Ogawa1,2, Takeshi Yokoyama1, Yoshikazu Tanaka1 (1.Life Sci., Tohoku Univ., 2.Agri. Tohoku Univ., 3.Sci. Kitasato Univ.)

本研究では、熱帯地方の海綿抽出物中に見出された新規レクチン様タンパク質の構造と機能の解析に取り組んだ。糖結合カラムを用いた実験により、このレクチン様タンパク質がフコース、マンノースと結合することが確認できたため、これらの糖との複合体のX線結晶構造解析を行なった。明らかになった構造は二量体であり、二か所の糖結合部位を有していた。糖結合部位では、一方のプロトマーの4個のカルボキシル基と、もう一方のプロトマーのC末端カルボキシ基が水分子やCa2+イオンを介して糖と結合していた。C末端にグリシンを付加した変異体では糖結合活性を示さなかったことから、C末端カルボキシ基が適切な位置に配置されることが糖結合に重要であることが示された。さらに、等温滴定型熱量測定(ITC)および表面プラズモン共鳴(SPR)によりフコース、マンノースとの結合の詳細を評価したところ、フコースにはKD=4μM程度の強さで結合するものの、マンノースに対する結合はフコースに比べて著しく低いことがわかった。糖結合カラムを用いた実験やX線結晶構造解析では2つの糖鎖の結合に差異が確認されなかったのに対し、ITCやSPRによる精密相互作用解析では大きな違いが確認されたことは注目すべき点である。これらの結果は、高濃度の試料を用いて行う生化学実験や結晶構造解析で得られる結果が、必ずしも正しい分子特性を示さないことがあることを意味しており、構造解析と精密な物理化学的解析を並行して実施することの重要性が改めて示された。