医療健康データ統合研究教育拠点（C-HiT）の医療データ部門では、名古屋大学と岐阜大学の電子カルテデータの統合、リアルワールドデータを利用した臨床研究や医療AI研究の解析基盤の整備、データベース利活用研究、に取り組んでいる。
電子カルテデータの統合においては、各大学でopenEHRに準拠した標準化リポジトリを構築しており、ベンダー中立、技術的中立の形式でデータの国際比較が可能となっている。これまでに、患者基本情報（年齢、性別、居住地、出生地など）、入退院情報、ライフスタイル（喫煙歴、飲酒歴等のプロファイル情報）、病名/プロブレム、処方/注射オーダと実施情報、プログレスノート（診療記録）、バイタルサイン、検体検査結果（検体・細菌・病理）、検査レポート、などを出力している。また、臨床研究の解析基盤を整備するため、医療用辞書や医療用オントロジーデータと、非構造化カルテ情報からopenEHRアーキタイプへマッピングするテーブルを作成している。今後、臨床研究のユースケースを実施することで標準化リポジトリのデータや解析基盤の検証と課題整理を行う予定である。