2022年第69回応用物理学会春季学術講演会

講演情報

一般セッション(口頭講演)

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[23p-E104-1~16] 12.6 ナノバイオテクノロジー

2022年3月23日(水) 13:00 〜 17:30 E104 (E104)

住友 弘二(兵庫県立大)、三浦 篤志(北大)、瀧ノ上 正浩(東工大)

13:00 〜 13:15

[23p-E104-1] 新型コロナウイルスの変異株RBDとACE2との複合体に関するMD-FMO連携計算による解析

〇秋澤 和輝1、奥脇 弘次1、北原 駿1、太刀野 雄介1、山本 詠士2、平野 秀典2、泰岡 顕治2、望月 祐志1,3 (1.立教大理、2.慶應大理工、3.東大生研)

キーワード:新型コロナウイルス、MD-FMO連携計算、相互作用解析

SARS-CoV-2は感染に関わる表面のSpikeタンパク質に変異が生じると、結合の標的とするヒトの細胞表面にあるアンジオテンシン転換酵素2 (ACE2)との相互作用が増加して感染力の増加に繋がる場合があり、分子論的な理解は重要です。今回、分子動力学(MD)シミュレーションによる多数の構造サンプルに対して一括してFMO計算を行う「MD-FMO連携アプローチ」を変異型のSpikeタンパク質とACE2複合体構造に適用し、フラグメント間相互作用エネルギー(IFIE)の統計的な評価を行いました。その結果、変異株と野生型では相互作用形態が一部変化していることがわかりました。