[ODP5A] a. Isolation and Characterization of Clinical Microbes

[ODP-088] Whole-genome sequencing of EHEC OX18 from a fatal HUS case and other EHEC OX18 isolates

○Ken-ichi Lee¹, Atushi Iguchi², Kazuhiro Uda³, Soushi Matsumura³, Isao Miyairi³, Kenji Ishikura³, Makoto Ohnishi¹, Sunao Iyoda¹, EHEC Working Group in Japan⁴ (¹Dept. Bacteriol. 1, Natl. Inst. Infect. Dis., ²Dept. Agriculture, Univ. Miyazaki, ³National Center for Child Health and Development, ⁴Local Public Health Institutes)

尿路感染症から続発した溶血性尿毒症症候群（HUS）の症例から，既存の抗血清では型別できない腸管出血性大腸菌（EHEC）が分離された。MiSeq（Illumina）を用いて全ゲノム配列を解析してO抗原決定領域を調べたところ，同菌株は新規血清群OX18であることが明らかとなった。そこで，OX18のO群決定遺伝子のPCR検出系を確立し，2007年以降に分離されたO群型別不能EHECの型別を行った結果，新たに25株のEHEC OX18が検出された。前述のHUS由来株を含めた計26株の全ゲノム解析を解読し，コアゲノムSNPによる系統解析および保有病原性因子の解析等を行ったところ，有症者から分離されたOX18はH型（H2，H19，H34）毎に3種の系統へ分類された。HUS由来のOX18:H2およびOX18:H19株は，いずれも3型蛋白質輸送装置をコードするLEE遺伝子群を保有せず，STEC agglutinating adhesin（Saa）遺伝子やサチラーゼ毒素（Sub）遺伝子を保有し，重症例由来LEE非保有のEHECに特徴的な類似した病原性遺伝子プロファイルを示した。一方，OX18:H34はH2およびH19とは系統が大きく異なり，細胞への接着因子としてはPap線毛をコードしていた。EHEC OX18は，散発的にではあるが，近年継続的に重症例から分離されており，Og型別等によって発生動向を注視する必要がある。
【発表者所属】宇田和宏（都立小児総合医療センター・感染症科），松村 壮史（神奈川県立こども医療センター・腎臓内科），石倉健司（北里大学医学部小児科学）