The 21st Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan

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Poster Session

[1P-1] Poster 1 (1P-01ー1P-48)

Wed. Jun 16, 2021 2:45 PM - 4:45 PM Poster 1

[1P-13*] X-ray crystallographic structure analysis of L-methionine decarboxylase Y421F mutant from Streptomyce sp. 590

Tomoaki Inoue1, Saki Hashimoto1, Atsushi Okawa2, Takashi Tamura2, Kenji Inagaki2, Shigeharu Harada1, Tomoo Shiba1 (1.Dept. Appl. Biol., Grad. Sch. Sci. and Tech., Kyoto Inst. of Tech, 2.Grad. Sch. Env. & Life Sci., Okayama Univ.)

L-メチオニン脱炭酸酵素MetDCは、ピリドキサール5’-リン酸 (PLP) を補酵素として、L-メチオニン (L-Met) の脱炭酸反応を触媒する。最近我々の研究室でMetDCの結晶構造を決定したが、MetDCがどのように基質L-Metを認識しているかについての詳細は明らかになっていない。本研究では、活性部位付近に存在する421位のチロシン残基に注目して、酵素反応での役割を明らかにするために、Y421F変異酵素を用いて生化学的な解析とX線結晶構造解析を行った。
本研究では、Y421F変異MetDCについて、活性部位にL-MetおよびL-Methionine methyl ester(MME)が結合した構造をそれぞれ1.9Åの分解能で決定した。これにより、Y421F変異MetDCの基質結合に伴う触媒ループの構造変化がみられた。L-Metとの複合体は活性部位が開いたOpenのコンフォメーションをとっていたのに対し、MMEとの複合体は活性部位が閉じたClosedのコンフォメーションをとっていた。また、L-Metとの複合体では、補酵素がPLPからピリドキサミン-5-リン酸(PMP)に変化していた。また、Y421F変異MetDCの活性測定および吸収スペクトル解析より、Y421F変異MetDCでは、3-メチルチオプロピオンアルデヒドの生成がみられ、補酵素がPLPからPMPに変化している可能性が示唆されているが、このことは構造解析の結果と一致している。