09:10 〜 09:20
[IX29-02] 黒毛和種におけるSTRA6遺伝子多型の探索
【目的】STRA 6はRBP4の受容体である．ビタミンA（VA）は各種細胞の増殖・分化，成長作用などの生理作用を持ち，黒毛和種の脂肪交雑を制御することが知られている．VAのうちレチノールはRBP4により輸送され，STRA6を介して細胞内に取り込まれるため，STRA6の多型は枝肉形質に影響する可能性がある．そこで，STRA6の全18 exonとその周辺の多型を探索した．
【方法】黒毛和種490頭から同一種雄牛の産子が2頭を超えないように選抜した73頭のゲノムDNAを用いて，ダイレクトシーケンスによって多型を探索した．
【結果】STRA6のexon 1，4~6および18を除く各exonとその周辺領域の多型探索をほぼ完了し， c.866A>G（exon 9），c.868-85C>T（intron 10），c.983A>G（exon 11），c.1169+79G>A（intron 12），c.1357C>T（exon 14）および c.1611C>T（exon 16）の6 SNPsを検出した．これらは全て既知SNPであり，c.866A>Gのみアミノ酸置換を伴った（p.Q289R）． c.866A>G（p.Q289R）のタンパク機能への影響をPolyPhen-2によって予測したところ，有害な変異ではないことが示唆されたため，今後，各種枝肉形質との関連を調べる予定である．また残りの領域についても多型の有無を確認中である．
【方法】黒毛和種490頭から同一種雄牛の産子が2頭を超えないように選抜した73頭のゲノムDNAを用いて，ダイレクトシーケンスによって多型を探索した．
【結果】STRA6のexon 1，4~6および18を除く各exonとその周辺領域の多型探索をほぼ完了し， c.866A>G（exon 9），c.868-85C>T（intron 10），c.983A>G（exon 11），c.1169+79G>A（intron 12），c.1357C>T（exon 14）および c.1611C>T（exon 16）の6 SNPsを検出した．これらは全て既知SNPであり，c.866A>Gのみアミノ酸置換を伴った（p.Q289R）． c.866A>G（p.Q289R）のタンパク機能への影響をPolyPhen-2によって予測したところ，有害な変異ではないことが示唆されたため，今後，各種枝肉形質との関連を調べる予定である．また残りの領域についても多型の有無を確認中である．