育種・遺伝Ⅱ

[VI-20-07] ホルスタイン種雄牛における精液性状形質の近交退化量の推定

*渡邉 千馬¹、勝畑 佑太¹、藤元 郁子²、花牟禮 武史²、岡 太郎³、馬場 俊見⁴、川上 純平⁴、萩谷 功一¹ (1. 帯畜大畜産、2. ジェネティクス北海道、3. 日ホ協会、4. 日ホ北支局)

【目的】本研究は、ホルスタイン種雄牛の精液性状形質の近交退化量を推定することを目的とした。【方法】分析には、日本ホルスタイン登録協会に蓄積されたホルスタイン雌牛8,244,509個体および雄牛192,480個体の血統データ、雄牛5,629個体のSNP情報、ジェネティクス北海道が2008年から2021年に収集したホルスタイン種雄牛808個体の採取量(ml)、精子濃度(×10⁸/ml)、精子数(×10⁸)および新鮮活力(%)の採精データ(53,916記録)を利用した。血統由来の近交係数(F_PED)は再帰的方法を用いて推定した。SNP情報由来の近交係数(F_ROH)は、ホモ接合領域 (ROH) について、ROH内のSNPの最小数40、最短4Mb、SNP欠測上限2、最小密度100kbごとに1 SNP、連続するSNP間の最大間隔1Mbを満たす領域とし、PLINKを使用して推定した。数学モデルには、採取年、採取月、採取場所、採精回次および採取方法を離散変数、採取月齢に対する1次および2次、F_PED またはF_ROHに対する1次の共変量の母数効果、採取者、個体および残差を変量効果として含めた。【結果】近交係数1%あたりの近交退化量推定値は、F_PEDとF_ROHでそれぞれ、採取量−0.056と−0.023、精子濃度0.050と−0.005、精子数−0.42と−0.32、新鮮活力0.094と0.020であった。